科学家开发出基于内镜活检组织的结直肠癌MSI
检测新方法

结直肠癌（CRC）是全世界第三常见的癌症，也是全世界癌症相关死亡的第二大原因，可以导致严重伤害和死亡。近年来，以PD-1抑制剂为代表的免疫治疗已经成为CRC治疗的研究热点。有证据表明，错配修复缺陷（dMMR）或高度微卫星不稳定（MSI-H）的CRC患者可以从免疫治疗中获益。传统MMR/MSI检测方法包括免疫组化、多重聚合酶链式反应PCR和二代测序，然而这些检测程序可能需要花费几天甚至几周的时间，并且对设备和操作人员提出了较高的要求。因此，当前急需开发新MSI预测方法以加快CRC患者MSI状态的确认并加速临床治疗决策。

近日，德国慕尼黑工业大学的研究团队在《Cancer Cell》期刊上发表题为“Transformer-based biomarker prediction from colorectal cancer histology: A large-scale multicentric study”的研究文章。该研究提出了基于Transformer模型的组织病理图像MSI检测方法，并证实其在切除组织和内镜活检组织中均取得良好的MSI预测性能。

研究人员基于Transformer特征提取器和聚合模型建立了完全基于Transformer模型的MSI预测算法。在切除组织病理图像MSI检测应用中，该算法在DACHS等大型单一队列中实现了AUC为0.95的MSI-H检测性能，在多个队列训练后实现了99%的灵敏度和99%的阴性预测值的MSI-H检测性能，并且证实该算法具有良好的可解释性和更小的数据量需求。在内镜组织活检病理图像MSI检测应用中，该算法在两个外部验证队列中实现了AUC为0.92和0.86的MSI-H检测性能，表明该算法在组织活检上具有良好的临床应用潜力。

该研究建立了完全基于Transformer模型的MSI预测算法，在切除组织和内镜活检组织中均展现出良好的MSI-H检测性能，有望应用于CRC患者的内镜组织活检并提供MSI的状态信息，加快MSI状态的确认并为临床治疗决策提供有力支持。

论文链接：

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1535610823002787

注：此研究成果摘自《Cancer Cell》期刊，文章内容并不代表本网站的观点和立场，仅供参考。