胎儿的产前基因筛查可以提供临床建议，并为个性化医疗提供数据基础。无创产前筛查可以检测非整倍体及与产前诊断相关的少量变异，可能极大的改变胎儿筛查手段。但是现有的无创筛查方法分辨率较低，且全面基因检测仍需要羊膜腔穿刺等有创操作,因此其应用主要局限于染色体异常遗传疾病。

近日，美国麻省总医院的研究团队在《The New England Journal of Medicine》期刊上发表题为“High-Resolution and Noninvasive Fetal Exome Screening”的研究论文。该研究介绍了一种有可能广泛应用的高分辨率无创产前筛查方法，该方法通过循环游离DNA（cfDNA）检测胎儿整个外显子组。

该研究收集了51份不同胎龄的孕妇母体血浆样本，其中5名孕妇处于妊娠早期，9名处于妊娠中期，37名处于妊娠晚期。研究利用基于机器学习的流程发现了单核苷酸变异（SNV）和插入或缺失（indel）（该流程对胎儿cfDNA比例和cfDNA的其他序列特征建模），并探索了拷贝数变异（CNV）读取深度。结果显示该方法在发现SNV方面非常灵敏（灵敏度中位数96.3%）。对于indel，新发indel和父系遗传indel灵敏度中位数为81.9%，母系杂合遗传变异的灵敏度中位数为71.3%。在接受过有创筛查的14个样本中，该方法成功检测出已发现的所有CNV。

本研究基于机器学习手段建立了一种高分辨率无创产前胎儿外显子筛查方法，该方法可在核苷酸级分辨率对胎儿各胎龄新发变异进行稳健筛查，而不会对胎儿和孕妇造成风险，将有机会提高治病变异的早期检出率、减少有创检查次数、促进及时干预。

论文链接：https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2216144

注：此研究成果摘自《The New England Journal of Medicine》杂志，文章内容并不代表本网站的观点和和立场，仅供参考。