结核病仍然是世界范围内致死率较高的传染病之一。目前临床仍需要有效的结核病患者筛查战略。全血RNA已经作为结核病的生物标志物进行了测试,但未能满足世界卫生组织(WHO)的最佳目标产品 (TPP)要求。目前的结核病诊断测试难以评估疾病的状态,无法确定感染是否已被清除,无法区分潜伏性、早期和亚临床疾病,也无法预测进展为活动性结核病。现有诊断试验缺乏敏感性和特异性,这对结核病的管理和控制构成了重大挑战。
近日,美国康奈尔大学梅宁生物医学工程学院的研究团队在《nature communications》发表了题为“Circulating cell-free RNA in blood as a host response biomarker for detection of tuberculosis”的文章。研究团队对来自乌干达、越南和菲律宾的持续咳嗽超过两周的门诊患者的血液样本中的RNA进行了高通量测序。结果发现由6个cfRNA构成的组合,能够有效区分结核人群和肺结核人群。
该研究共收集了251名咳嗽至少持续了两周的受试者血浆样本,并按照结核诊断标准进行分类。在251例样本中,有142份(56.6%)来自微生物学确诊的结核病患者,37份(14.7%)来自艾滋病毒感染者。通过对这些患者血浆样本中的RNA进行高通量测序,最终发现了由6个cfRNA组成的诊断组合,分别是GBP5、BNP3L、KLF6、DYSF、LASP1、PCBP1。通过贪婪最佳优先搜索计算模型进行计算,发现该组合对于结核病诊断的灵敏度可达97.1%,特异性可达76.0%。其中,仅GBP5与WHO报告的全血RNA的标志物重叠,通过对比GBP5的cfRNA与全血RNA的诊断性能,结果发现,cfRNA的AUC值(AUC:0.88)高于目前已经报告过的全血RNA的AUC值(0.86),如Francisco。此外,相比全血GBP5蛋白检测(AUC:0.76),GBP5的cfRNA的诊断性能也更优。
该研究筛选得到的由6个cfRNA组成的诊断标志物组合与目前WHO推荐的全血RNA标志物相比,具有更优的诊断性能。这一研究结果表明血浆cfRNA是一类具有研究前景的诊断结核病的宿主生物标志物,有助于早日实现WHO的“end TB” 计划。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-49245-6
注:此研究成果摘自《nature communications》杂志,文章内容并不代表本网站的观点和和立场,仅供参考。