急性髓性白血病(AML)是一种进展迅速且复杂多样的血液癌症,其主要特征为骨髓与外周血中原始和幼稚髓性细胞异常增生,多数病例病情急重,预后凶险,如不及时治疗常可危及生命。目前的治疗手段虽然极大提高了患者的缓解率,但患者体内可能残留极少量的癌细胞导致疾病复发,这是急性髓系白血病临床治疗面临的主要挑战之一。监测微小残留病灶(MRD)在定量评估AML复发中起着至关重要的作用。目前,基于多色流式细胞术免疫表型分析的为MRD检测提供了丰富的信息,但临床上约有20%-70%的患者复发时多色流式细胞术结果数值偏低或为阴性。开发高灵敏度、高特异性、普遍适用于各种AML患者并精准评估复发风险的MRD分子检测方法具有重要意义。
近日,首都医科大学吴若嘉教授团队在《Nature Communications》上发表了研究论文“Longitudinal Ultra-sensitive Mutation Burden Sequencing for Precise Minimal Residual Disease Assessment in AML”。该研究报道了一种基于超灵敏突变负荷定量分析的监测策略,使用研究团队最近开发的检测限低于0.01% VAF的定量阻断剂置换扩增测序(QBDA)技术,对各种基因异常类型AML患者均实现了准确的MRD检测并预测复发。
研究团队根据My Cancer Genome和COSMIC数据库信息,设计了针对AML常见突变热点基因组区域的QBDA基因检测panel,panel中所有检出的突变丰度之和被定义为UMB。该方法基于这样一种假设:在同一个体中肿瘤细胞比正常细胞有着更高的总突变率,通过监测完全缓解期(CR)患者的骨髓穿刺样本中UMB变化可以预测复发。对20例患者在CR期至少两个不同时间点采集样本,并进行复发累积发生率(CIR)分析,UMB+(UMB在CR期间上升)与UMB-组(UMB在CR期间下降或不变)相比,其AML复发风险比为 14.8(p < 0.001)。该方法用于预测患者在CR时间点2之后30周内复发这一事件时,ROC曲线下面积为0.98。此外,研究团队还证明了精准定量到低于0.01% VAF的超低丰度突变,对基于UMB的AML复发预测至关重要。
上述研究应用定量阻断剂置换扩增测序技术,开发了基于超灵敏突变负荷的微小残留病灶监测策略,并验证了其在急性髓系白血病不同风险组别或治疗方法的病例中均对复发有良好的预测效果。与基于流式细胞术或特定基因变异检测的传统方法相比,该技术有望为急性髓性白血病微小残留病灶的精确评估提供一种更灵敏的新策略。
论文链接: https://www.nature.com/articles/s41467-024-54254-6
注:此研究成果摘自《Nature Communications》杂志,文章内容并不代表本网站的观点和和立场,仅供参考。